Les dépenses de la MSA sont essentiellement constituées par les prestations. Le financement est plus diversifié. Il est constitué par les cotisations, mais aussi par des recettes provenant de produits financiers, de financement reçus dans le cadre des affectations budgétaires de l'Etat et/ou de compensation diverses dans le cadre du financement plus global de la Sécurité sociale. En 2023, la MSA a versé 28,6 milliards d'euros de prestations. Ses recettes s'élèvent à 32,7 milliards d'euros